4月1日0時、謎の凶暴化した「まちなみくん」が海から上陸。街を破壊しながら、進行を開始した。
「てつてっつ」たちは、「なつめゆうすけくん」を中心とした「まちなみくん特設災害対策本部」を設置。
なつめゆうすけくんは、この凶暴化したまちなみくんを他の無害なまちなみくんと区別するため、「ゴヂナミクン」と呼ぶことにした。
ゴヂナミクンは、形態を変えながらさらに強力になっていった……
まちなみくん特設災害対策本部の面々は様々な対策を講じるが、すべて失敗。
無人の電車に爆弾を積んでぶつけるわけにもいかない……!
そんななか、最終的になつめくんがうちだした戦い方とは――